L’Etablissement soutien techniquement et financièrement des projets de recherche sur :
• les cyanobactéries toxiques présentes notamment dans l’eau des retenues de Naussac et de Villerest. : DIVERSITOX (2016-2018), ANATOX (2015) et PROFECY (2011-2014);
• l’évaluation de la qualité du réservoir sédimentaire de Naussac (2015-2016);
• les « Transferts de contaminants au cours de la dynamique sédimentaire vers les milieux aquatiques – TRIO» (2016-2018) et la distribution spatiale des éléments-trace dans les sédiments en amont du lac de barrage de Villerest (2010-2012).